NVT: a fast and simple tool for the assessment of RNA-seq normalization strategies
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
OSA: a fast and accurate alignment tool for RNA-Seq
UNLABELLED Accurately mapping RNA-Seq reads to the reference genome is a critical step for performing downstream analysis such as transcript assembly, isoform detection and quantification. Many tools have been developed; however, given the huge size of the next generation sequencing datasets and the complexity of the transcriptome, RNA-Seq read mapping remains a challenge with the ever-increasi...
متن کاملdiagnostic and developmental potentials of dynamic assessment for writing skill
این پایان نامه بدنبال بررسی کاربرد ارزیابی مستمر در یک محیط یادگیری زبان دوم از طریق طرح چهار سوال تحقیق زیر بود: (1) درک توانایی های فراگیران زمانیکه که از طریق برآورد عملکرد مستقل آنها امکان پذیر نباشد اما در طول جلسات ارزیابی مستمر مشخص شوند; (2) امکان تقویت توانایی های فراگیران از طریق ارزیابی مستمر; (3) سودمندی ارزیابی مستمر در هدایت آموزش فردی به سمتی که به منطقه ی تقریبی رشد افراد حساس ا...
15 صفحه اولAssessment of Single Cell RNA-Seq Normalization Methods
We have assessed the performance of seven normalization methods for single cell RNA-seq using data generated from dilution of RNA samples. Our analyses showed that methods considering spike-in External RNA Control Consortium (ERCC) RNA molecules significantly outperformed those not considering ERCCs. This work provides a guidance of selecting normalization methods to remove technical noise in s...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Bioinformatics
سال: 2016
ISSN: 1367-4803,1460-2059
DOI: 10.1093/bioinformatics/btw521